生物技术

开发平台：
C/C++

phylo_tree_ds.hpp：源码内容
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 * PRODUCTION $Log: phylo_tree_ds.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:52:54  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.10
 * PRODUCTION
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 */
#ifndef GUI_WIDGETS_PHYLO_TREE__PHYLO_TREE_DS_HPP
#define GUI_WIDGETS_PHYLO_TREE__PHYLO_TREE_DS_HPP
/*  $Id: phylo_tree_ds.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:52:54 gouriano Exp $
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 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
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 * Authors:  Vladimir Tereshkov
 *
 * File Description:
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 */
#include <corelib/ncbistd.hpp>
#include <corelib/ncbiobj.hpp>
#include <corelib/ncbi_tree.hpp>
#include <gui/widgets/phylo_tree/phylo_tree_node.hpp>
#include <gui/widgets/phylo_tree/phylo_tree_reader.hpp>
#include <gui/opengl/glpane.hpp>
#include <algo/phy_tree/phy_tree_serial.hpp>
#include <objmgr/scope.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
class  NCBI_GUIWIDGETS_PHYLO_TREE_EXPORT CPhyloTreeDataSource : public CObject
{
public:    
    typedef map<int, CPhyloTreeNode *> TNodeHash;
    typedef CPhyTreeSerial::TIds TIds;
    CPhyloTreeDataSource();    
    CPhyloTreeDataSource(IPhyloTreeReader * reader);
    CPhyloTreeDataSource(TPhyTreeNode& node,
                         const TIds& seqids, 
                         objects::CScope& scope);
    virtual ~CPhyloTreeDataSource();        
    void Init(IPhyloTreeReader * reader);
    void Init(TPhyTreeNode & node,  CPhyloTreeNode * pos); 
    CPhyloTreeNode* GetTree(void);
    Int4 GetWidth(void) { return m_Width; }
    Int4 GetSize(void)  { return m_Size; }    
    void SetSelection(CPhyloTreeNode * node, bool bSel,
                      bool andChilds = true, bool checkParents = true);
    vector<int> GetSelectedIds(void) const;    
    
    TIds ConvertId2SeqId(const vector<int> & ids);
    vector<int> ConvertSeqId2Id(const TIds& seqids);
    TNodeHash& GetHash(void) { return m_Hash; }
    CPhyloTreeNode* GetNode(int idx);    
    // returning calculated bounding rectangle
    const TModelRect GetBoundRect(void);
    // returning norm distance
    const double GetNormDistance(bool fromRoot=true);
private:
    int m_Level;    
    CPhyloTreeNode* m_Root;
    TNodeHash m_Hash; 
    
    int m_Width;
    int m_Size;
    TIds       m_SeqIds;    
    CRef<objects::CScope>    m_Scope;
    
    void x_MeasureTree(CPhyloTreeNode * node);  
    void x_DescentToChilds(CPhyloTreeNode * node, bool bSel);
    void x_AscendToRoot(CPhyloTreeNode * node, bool bSel);
};
END_NCBI_SCOPE
/*
 * ===========================================================================
 * $Log: phylo_tree_ds.hpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/06/01 19:52:54  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.10
 *
 * Revision 1.10  2004/05/11 20:53:38  tereshko
 * Work in progress
 *
 * Revision 1.9  2004/04/28 19:27:27  tereshko
 * Added support for distances rendering
 *
 * Revision 1.8  2004/04/16 14:33:59  dicuccio
 * Formatting changes.  Added typedefs for IDs, node map
 *
 * Revision 1.7  2004/04/13 20:29:22  tereshko
 * Numerous renderers improvements
 *
 * Revision 1.6  2004/04/02 16:20:29  yazhuk
 * Replaced vector<CRef<>> with vector<CConstRef<>>, added Scope data member
 *
 * Revision 1.5  2004/04/01 21:47:00  tereshko
 * Added ability of auto-selecting parent nodes
 *
 * Revision 1.4  2004/03/31 17:53:09  tereshko
 * Added function for retrieval of preprocessed selection
 *
 * Revision 1.3  2004/03/30 17:11:08  tereshko
 * Added support for events broadcasting
 *
 * Revision 1.2  2004/02/17 23:44:11  tereshko
 * Changes due to integration into viewer
 *
 * Revision 1.1  2004/02/13 16:59:58  tereshko
 * Phylogenetic Tree Widget initial revision
 *
 * ===========================================================================
 */
#endif 

						