phylo_tree_reader.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: phylo_tree_reader.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/04/16 19:22:55  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #if !defined(AFX_PHYLO_TREE_READER_HPP__98E3CB4B_9A98_4239_9733_5C60FAB0E84F__INCLUDED_)
  10. #define AFX_PHYLO_TREE_READER_HPP__98E3CB4B_9A98_4239_9733_5C60FAB0E84F__INCLUDED_
  11. /*  $Id: phylo_tree_reader.hpp,v 1000.0 2004/04/16 19:22:55 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Vladimir Tereshkov
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  42. #include <corelib/ncbiobj.hpp>
  43. #include <corelib/ncbi_tree.hpp>
  44. #include <gui/widgets/phylo_tree/phylo_tree_node.hpp>
  45. BEGIN_NCBI_SCOPE
  46. class IPhyloTreeReader {
  47. public:    
  48.     virtual CPhyloTreeNode * GetTree(void) = 0;
  49. };
  50. class NCBI_GUIWIDGETS_PHYLO_TREE_EXPORT CPhyloPhylipReader :public IPhyloTreeReader {
  51. protected:
  52.     string m_Phylip;
  53.     
  54.     CPhyloTreeNode * x_Parse(CPhyloTreeNode * par, string str);
  55.     void x_Tokenize(const string& str,  vector<string>& tokens, const string& delimiters = " ");    
  56. public:    
  57.     CPhyloPhylipReader();
  58.     CPhyloPhylipReader(string str);
  59.     virtual ~CPhyloPhylipReader();
  60.     
  61.     virtual CPhyloTreeNode * GetTree(void);
  62. };
  63. END_NCBI_SCOPE
  64. /*
  65.  * ===========================================================================
  66.  * $Log: phylo_tree_reader.hpp,v $
  67.  * Revision 1000.0  2004/04/16 19:22:55  gouriano
  68.  * PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.2
  69.  *
  70.  * Revision 1.2  2004/02/17 23:44:17  tereshko
  71.  * Changes due to integration into viewer
  72.  *
  73.  * Revision 1.1  2004/02/13 17:00:02  tereshko
  74.  * Phylogenetic Tree Widget initial revision
  75.  *
  76.  * ===========================================================================
  77.  */
  78. #endif // !defined(AFX_PHYLO_TREE_READER_HPP__98E3CB4B_9A98_4239_9733_5C60FAB0E84F__INCLUDED_)