phylo_tree_node.hpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: phylo_tree_node.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:52:57  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #if !defined(AFX_PHYLO_TREE_NODE_HPP__2F61D68C_0454_4BD0_89F2_037863D53E27__INCLUDED_)
  10. #define AFX_PHYLO_TREE_NODE_HPP__2F61D68C_0454_4BD0_89F2_037863D53E27__INCLUDED_
  11. /*  $Id: phylo_tree_node.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:52:57 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Vladimir Tereshkov
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  42. #include <corelib/ncbiobj.hpp>
  43. #include <corelib/ncbi_tree.hpp>
  44. #include <serial/serialbase.hpp>
  45. #include <serial/stdtypes.hpp>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. class CPhyloTreeNode : public CTreeNode<CPhyloTreeNode*>                       
  48. {
  49. private:
  50.     // primary node data
  51.     string  m_Label;
  52.     double  m_Distance; 
  53.     // visualization data  
  54.     int                    m_ID;
  55.     pair <double, double>  m_XY;    
  56.     pair <int, int>        m_IDX;
  57.     double                 m_Alpha;
  58.     bool                   m_Selected;
  59.     // useful for visualization params
  60.     // = ( leaves of current node / leaves of parent node ) * annulus wedge of parent
  61.     // for root let it be 360 - which will make sense for radial tree
  62.     double                 m_AnnWedge;    
  63.     void x_CountLeafs(CPhyloTreeNode * node, Int4 & lfCount);
  64. public:  
  65.     CPhyloTreeNode();
  66.     CPhyloTreeNode(int id, string label, double dist);
  67. virtual ~CPhyloTreeNode();
  68.     const string & GetLabel(void) const;
  69.     const double   GetDistance(void) const;
  70.     const double   GetDistFromRoot(void) const;
  71.     
  72.     void SetLabel(string label);
  73.     void SetDistance(double dist);    
  74.     
  75.     pair <double, double>  & XY(void)   { return m_XY;  }
  76.     pair <int, int>        & IDX(void)  { return m_IDX; }  
  77.     bool GetSelected(void)              { return m_Selected; }
  78.     void SetSelected(bool bSel)         { m_Selected = bSel; }
  79.     double GetAnnWedge(void)            { return m_AnnWedge;  }
  80.     void   SetAnnWedge(double wedge)    { m_AnnWedge = wedge; }
  81.     double GetAngle(void)               { return m_Alpha;  }
  82.     void   SetAngle(double angle)       { m_Alpha = angle; }
  83.     int    GetID(void)                  { return m_ID;     }
  84.     void   SetID(int id)                { m_ID = id;       }
  85.     // function counts amount of end-leafs in childs
  86.     Int4   CountLeafs(void);
  87. };
  88. END_NCBI_SCOPE
  89. /*
  90.  * ===========================================================================
  91.  * $Log: phylo_tree_node.hpp,v $
  92.  * Revision 1000.1  2004/06/01 19:52:57  gouriano
  93.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  94.  *
  95.  * Revision 1.4  2004/04/28 19:27:27  tereshko
  96.  * Added support for distances rendering
  97.  *
  98.  * Revision 1.3  2004/03/30 17:11:08  tereshko
  99.  * Added support for events broadcasting
  100.  *
  101.  * Revision 1.2  2004/03/02 18:28:50  tereshko
  102.  * Added support for calculating annual vertex weight
  103.  *
  104.  * Revision 1.1  2004/02/13 16:59:59  tereshko
  105.  * Phylogenetic Tree Widget initial revision
  106.  *
  107.  * ===========================================================================
  108.  */
  109. #endif // !defined(AFX_PHYLO_TREE_NODE_HPP__2F61D68C_0454_4BD0_89F2_037863D53E27__INCLUDED_)
  110.