aln_table.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: aln_table.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:51:54  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_WIDGETS_ALN_TABLE___ALN_TABLE__HPP
  10. #define GUI_WIDGETS_ALN_TABLE___ALN_TABLE__HPP
  11. /*  $Id: aln_table.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:51:54 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <corelib/ncbiobj.hpp>
  42. #include <gui/widgets/fl/table_panel.hpp>
  43. #include <objmgr/scope.hpp>
  44. #include <objects/seqalign/Seq_align.hpp>
  45. #include <gui/widgets/aln_table/aln_table_ds.hpp>
  46. #include <gui/objutils/iselection.hpp>
  47. BEGIN_NCBI_SCOPE
  48. class NCBI_GUIWIDGETS_ALNCROSSALN_EXPORT CAlnTableWidget
  49.     : public CTablePanel<SAlnProxy>
  50.     , public ISelection
  51. {
  52. public:
  53.     enum EColumns {
  54.         eLabel,
  55.         eType,
  56.         eNumSeqs,
  57.         // must be last!
  58.         eScoreStart
  59.     };
  60.     CAlnTableWidget(int x, int y, int w, int h, const char* label = NULL);
  61.     void Add(objects::CScope& scope, const objects::CSeq_align& aln);
  62.     void SetDataSource(CAlnTableDS& ds);
  63.     void Update();
  64.     void GetSelections(TConstScopedObjects& objs) const;
  65.     void SetSelections(const TConstScopedObjects& objs);
  66. private:
  67.     // our data source
  68.     CRef<CAlnTableDS> m_DataSource;
  69.     // current column mappings (column idx -> title)
  70.     // We use this internally to allow us to be flexible in how we present
  71.     // columns - we can pick each form of alignment score out separately
  72.     // and place the score in a distinct column
  73.     typedef map<string, int> TColNames;
  74.     TColNames m_Cols;
  75.     void x_GetAlnLabel(const SAlnProxy& proxy, string& label);
  76.     size_t x_GetNumSeqs(const SAlnProxy& proxy);
  77. };
  78. END_NCBI_SCOPE
  79. /*
  80.  * ===========================================================================
  81.  * $Log: aln_table.hpp,v $
  82.  * Revision 1000.1  2004/06/01 19:51:54  gouriano
  83.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  84.  *
  85.  * Revision 1.2  2004/05/03 12:47:08  dicuccio
  86.  * Added #include for gui/gui.hpp.  gui/utils ->gui/objutils where needed.
  87.  *
  88.  * Revision 1.1  2004/04/16 15:57:04  dicuccio
  89.  * Initial revision
  90.  *
  91.  * ===========================================================================
  92.  */
  93. #endif  // GUI_WIDGETS_ALN_TABLE___ALN_TABLE__HPP