default_layoutpolicy.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: default_layoutpolicy.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 19:53:13  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___DEFAULT_LAYOUTPOLICY__HPP
  10. #define GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___DEFAULT_LAYOUTPOLICY__HPP
  11. /*  $Id: default_layoutpolicy.hpp,v 1000.2 2004/06/01 19:53:13 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Vlad Lebedev
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <gui/gui.hpp>
  42. #include <gui/opengl/glpane.hpp>
  43. #include <gui/widgets/seq_graphic/ilayoutpolicy.hpp>
  44. #include <gui/objutils/feat_label.hpp>
  45. #include <gui/objutils/layout.hpp>
  46. #include <objmgr/util/feature.hpp>
  47. BEGIN_NCBI_SCOPE
  48. ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  49. /// CDefaultLayoutPolicy is a default layout policy for retrieving and
  50. /// packing, linking layout objects used in feature panel of seq_graphic widget.
  51. ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52. class NCBI_GUIWIDGETS_SEQGRAPHIC_EXPORT CDefaultLayoutPolicy : public ILayoutPolicy
  53. {
  54. public:
  55.     CDefaultLayoutPolicy();
  56.     virtual ~CDefaultLayoutPolicy() { };
  57.     // ILayoutPolicy interfaces
  58.     virtual void PrepareData(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects);
  59.     virtual void SetHandle(const objects::CBioseq_Handle& handle);
  60.     virtual void SetConfig(CSeqGraphicConfig* config);
  61. protected:
  62.     objects::CBioseq_Handle m_Handle;
  63.     CRef<CSeqGraphicConfig>  m_ConfigSettings;
  64.     
  65.     // Prepares data for full view mode
  66.     void x_PrepareDetailedView(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects);
  67.     // Prepares data for overview mode
  68.     void x_PrepareGenesOverview(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects);
  69.     bool x_IsOverviewMode(CGlPane& pane) const;
  70.     // Retrieve a measure of the minimum spacing in base pairs
  71.     TSeqPos x_GetMinSpacing(CGlPane& pane) const;
  72.     
  73.     void x_AddFeatureLabelsOverview(CLayoutFeatLabel::TFeatLabelList& labels,
  74.                                     CGlPane& pane, CLayout& lay_objects);
  75.     void x_AddSeqSegmentMap(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects, TSeqRange range);
  76.     void x_AddSequenceBar(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects, TSeqRange range);
  77.     void x_AddHistograms(CGlPane& pane, CLayout& lay_objects, TSeqRange range);
  78.     
  79.     // Perform a grid layout
  80.     void x_LayoutLabels(const CLayoutEngine::TObjects& objects, 
  81.                     CLayout& layout, int col_count);
  82.     // Segments
  83.     void GetSeqMaps(CLayoutEngine::TObjects& maps,
  84.                     const TSeqRange& visible_sequence);
  85. };
  86. // comparator to sort a list of features by their labels
  87. struct SFeatureByName
  88. {
  89.     bool operator() (CRef<CLayoutFeatLabel> f1, CRef<CLayoutFeatLabel> f2)
  90.     {
  91.         string label1;
  92.         objects::feature::GetLabel(f1->GetFeature(), &label1,
  93.                                    objects::feature::eContent);
  94.     
  95.         string label2;
  96.         objects::feature::GetLabel(f2->GetFeature(), &label2,
  97.                                    objects::feature::eContent);
  98.     
  99.         return label1 < label2;
  100.     }
  101. };
  102. END_NCBI_SCOPE
  103. /*
  104.  * ===========================================================================
  105.  * $Log: default_layoutpolicy.hpp,v $
  106.  * Revision 1000.2  2004/06/01 19:53:13  gouriano
  107.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  108.  *
  109.  * Revision 1.5  2004/05/03 12:46:32  dicuccio
  110.  * gui/utils ->gui/objutils where needed
  111.  *
  112.  * Revision 1.4  2004/04/16 14:34:36  dicuccio
  113.  * Use raw pointer for SetConfig() instead of CRef<>
  114.  *
  115.  * Revision 1.3  2004/03/23 12:33:57  lebedev
  116.  * Made sequence and histograms bars a layout objects in the object panel.
  117.  * Made segment map a number of layout objects. Get rid of fixed size rows in the object panel.
  118.  *
  119.  * Revision 1.2  2004/03/02 15:29:16  lebedev
  120.  * Switch to detailed mode if reached certain number of
  121.  * genes in visible range.
  122.  *
  123.  * Revision 1.1  2004/02/13 18:00:29  lebedev
  124.  * Initial revision
  125.  *
  126.  * ===========================================================================
  127.  */
  128. #endif  // GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___DEFAULT_LAYOUTPOLICY__HPP