seqgraphic_conf.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:8k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: seqgraphic_conf.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.3  2004/06/01 19:53:26  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.24
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___SEQGRAPHIC_CONF__HPP
  10. #define GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___SEQGRAPHIC_CONF__HPP
  11. /*  $Id: seqgraphic_conf.hpp,v 1000.3 2004/06/01 19:53:26 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Vlad Lebedev
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *   Configuration file for Sequence Graphical Widget
  40.  *
  41.  */
  42. #include <gui/config/theme_set.hpp>
  43. #include <gui/opengl/glcolor.hpp>
  44. #include <gui/widgets/seq_graphic/render_policy_conf.hpp>
  45. #include <gui/widgets/seq_graphic/layout_conf.hpp>
  46. #include <gui/widgets/seq_graphic/font_conf.hpp>
  47. #include <gui/widgets/seq_graphic/color_conf.hpp>
  48. #include <gui/widgets/seq_graphic/seqgraphic_widget.hpp>
  49. #include <gui/config/feat_decorate.hpp>
  50. BEGIN_NCBI_SCOPE
  51. class CPaneContentConf;
  52. //class CSeqGraphicColorConfig;
  53. class NCBI_GUIWIDGETS_SEQGRAPHIC_EXPORT CSeqGraphicConfig : public CThemeSet
  54. {
  55. public:
  56.     CSeqGraphicConfig(objects::CPluginConfigCache* config_cache, 
  57.                  const string& delim = "|");
  58.     ~CSeqGraphicConfig();
  59.      
  60.     /// the following methods are simply interfaces to the contained conf classes.
  61.     bool GetHistogram(int type, int subtype) const;
  62.     void SetHistogram(int type, int subtype, bool hist);
  63.     void SetHistogramInherited(int type, int subtype, bool inherited);
  64.         
  65.     bool        GetShow(int type, int subtype) const;
  66.     void        SetShow(int type, int subtype, bool show);
  67.     void        SetShowInherited(int type, int subtype, bool inherited);
  68.     
  69.     CGlColor    GetColor(int type, int subtype) const;
  70.     void        SetColor(int type, int subtype, CGlColor color);
  71.     void        SetColorInherited(int type, int subtype, bool inherited);
  72.     CGlColor    GetElementColor(CSeqGraphicColorConfig::EDisplayElement e) const;
  73.     void        SetElementColor(CSeqGraphicColorConfig::EDisplayElement e,  const CGlColor& c);
  74.     
  75.     bool        GetShowAlignments() const;
  76.     void        SetShowAlignments(bool );
  77.     
  78.     bool        GetSmearAlignments() const;
  79.     void        SetSmearAlignments(bool);
  80.     
  81.     bool        GetShowGraphs() const;
  82.     void        SetShowGraphs(bool );
  83.     bool        GetShowProtProd() const;
  84.     void        SetShowProtProd(bool);
  85.     bool        GetShowSegmentMap() const;
  86.     void        SetShowSegmentMap(bool);
  87.     
  88.     bool        GetShowPWAlignLabels() const;
  89.     void        SetShowPWAlignLabels(bool);
  90.     TSeqPos     GetOverviewCutoff() const;
  91.     void        SetOverviewCutoff(TSeqPos);
  92.     
  93.     int         GetRulerSpacer() const;
  94.     void        SetRulerSpacer(int);
  95.     TSeqPos     GetGenesCutoff() const;
  96.     void        SetGenesCutoff(TSeqPos);
  97.     
  98.     CRenderPolicyConfig::ERenderPolicys GetFeaturePanelRenderPolicy() const;
  99.     CLayoutConfig::ELayout              GetLayout() const;
  100.     
  101. private:
  102.     CRef<CRenderPolicyConfig>       m_FeatRenderPolicy;
  103.     CRef<CPaneContentConf>          m_Content;
  104.     CRef<CSeqGraphicColorConfig>    m_Color;
  105.     CRef<CLayoutConfig>             m_Layout;
  106.     CRef<CFontConfig>               m_Font;
  107.     CRef<CFeatConfigDecorate>       m_Decorations;    
  108.     // forbidden
  109.     CSeqGraphicConfig(const CSeqGraphicConfig&);
  110.     CSeqGraphicConfig& operator=(const CSeqGraphicConfig&);
  111. };
  112. END_NCBI_SCOPE
  113. /*
  114.  * ===========================================================================
  115.  * $Log: seqgraphic_conf.hpp,v $
  116.  * Revision 1000.3  2004/06/01 19:53:26  gouriano
  117.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.24
  118.  *
  119.  * Revision 1.24  2004/05/12 16:54:13  lebedev
  120.  * Added  option to specify a space between the ruler and the rest of the dispay
  121.  *
  122.  * Revision 1.23  2004/05/10 15:57:55  lebedev
  123.  * Configuration option to show/hide segment maps added.
  124.  *
  125.  * Revision 1.22  2004/05/07 11:12:14  lebedev
  126.  * Configuration option to show/hide labels for pairwise alignments and mate pairs added.
  127.  *
  128.  * Revision 1.21  2004/03/30 13:54:51  lebedev
  129.  * Use EDisplayElement list from CSeqGraphicColorConfig
  130.  *
  131.  * Revision 1.20  2004/03/22 16:51:00  rsmith
  132.  * add alignment smear setting.
  133.  *
  134.  * Revision 1.19  2004/03/02 15:26:40  lebedev
  135.  * Configure minimum number of genes as a cut-off between
  136.  * overview and detailed mode.
  137.  *
  138.  * Revision 1.18  2004/02/13 18:06:32  lebedev
  139.  * Methods for specifying Overview/Detail resolution cutoff added
  140.  *
  141.  * Revision 1.17  2004/02/12 14:56:06  rsmith
  142.  * Add skeleton methods GetShowAligments/Graphs and ProtProds.
  143.  *
  144.  * Revision 1.16  2004/02/05 16:05:28  rsmith
  145.  * add decorations settings
  146.  *
  147.  * Revision 1.15  2004/02/04 21:28:48  rsmith
  148.  * Add font configuration
  149.  *
  150.  * Revision 1.14  2004/02/04 15:16:41  rsmith
  151.  * add GetLayout method
  152.  *
  153.  * Revision 1.13  2004/01/20 18:11:53  dicuccio
  154.  * Added dtor / hidden copy ctor/assignment operator to make MSVC happy
  155.  *
  156.  * Revision 1.12  2004/01/20 14:00:16  rsmith
  157.  * Extensive rewrite to inherit from CThemeSet.
  158.  *
  159.  * Revision 1.11  2003/12/29 14:52:48  rsmith
  160.  * Get returns string not string&
  161.  *
  162.  * Revision 1.10  2003/12/22 12:52:05  lebedev
  163.  * Old files removed
  164.  *
  165.  * Revision 1.9  2003/11/21 12:55:55  rsmith
  166.  * Added ClearHistograms() to fix bug when loading data from the PluginConfigCache.
  167.  *
  168.  * Revision 1.8  2003/11/20 13:17:15  dicuccio
  169.  * Use the correct export specifier
  170.  *
  171.  * Revision 1.7  2003/11/19 20:18:16  friedman
  172.  * Requires export
  173.  *
  174.  * Revision 1.6  2003/11/18 20:46:51  rsmith
  175.  * Get and Set all color and show values at once. Add set/get of element colors.
  176.  *
  177.  * Revision 1.5  2003/10/31 14:07:22  dicuccio
  178.  * Un-inlined implementation
  179.  *
  180.  * Revision 1.4  2003/10/31 13:39:15  ivanov
  181.  * Added missing inline for SaveCurrentSettings()
  182.  *
  183.  * Revision 1.3  2003/10/30 14:49:21  rsmith
  184.  * Made into a real descedant of CSettings_Set, adding Factory Default object, methods Load/SaveCurrentSettings
  185.  *
  186.  * Revision 1.2  2003/10/28 19:04:10  dicuccio
  187.  * Code clean-up.  Changed storage of CBioseq_Handle from const pointer to value.
  188.  * Changed SFeatByName to use no scope internally.
  189.  *
  190.  * Revision 1.1  2003/10/28 15:26:51  lebedev
  191.  * Initial revision
  192.  *
  193.  * ===========================================================================
  194.  */
  195. #endif  /* GUI_WIDGETS_SEQ_GRAPHIC___SEQGRAPHIC_CONF__HPP */