生物技术

开发平台：
C/C++

obj_convert.hpp：源码内容
							/*
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 * PRODUCTION $Log: obj_convert.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 18:12:36  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.9
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
#ifndef GUI_CORE___OBJ_CONVERT__HPP
#define GUI_CORE___OBJ_CONVERT__HPP
/*  $Id: obj_convert.hpp,v 1000.1 2004/04/12 18:12:36 gouriano Exp $
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 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
 * Authors:  Mike DiCuccio
 *
 * File Description:
 *
 */
#include <corelib/ncbiobj.hpp>
#include <objmgr/scope.hpp>
#include <gui/core/idocument.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
//
// base interface for a conversion object
//
class IObjConverter : public CObject
{
public:
    typedef list< CConstRef<CObject> > TObjList;
    // generic handler interface
    // this, in general, feeds into the interfaces below
    virtual void ToObject   (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             const string& type_name, TObjList& objs) const = 0;
    // named conversion routines
    virtual void ToSeqSubmit(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqEntry (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToBioseqSet(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToBioseq   (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqId    (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqLoc   (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqFeat  (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqAlign (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
    virtual void ToSeqAnnot (objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                             TObjList& objs) const = 0;
};
//
// common subclass for object conversion
// this class defines some basic conversions that are generically handled,
// as well as provides the default switching function in ToObject()
//
class NCBI_GUICORE_EXPORT CObjConverter : public IObjConverter
{
public:
    // generic object conversion switch function
    void ToObject(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                      const string& type_name, TObjList& objs) const;
    // generic seq-entry -> seq-submit wrapper
    void ToSeqSubmit(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                     TObjList& objs) const;
    // generic seq-id -> seq-entry function
    void ToSeqEntry(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                    TObjList& objs) const;
    // generic seq-id -> bioseq function
    void ToBioseq(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                  TObjList& objs) const;
    // generic seq-submit -> bioseq-set function
    void ToBioseqSet(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                     TObjList& objs) const;
    // generic seq-id -> seq-loc wrapper
    void ToSeqLoc(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                  TObjList& objs) const;
    // generic seq-loc -> seq-annot wrapper
    void ToSeqAnnot(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                    TObjList& objs) const;
    // generic seq-loc -> seq-annot wrapper
    void ToSeqFeat(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                   TObjList& objs) const;
    // generic seq-loc -> seq-annot wrapper
    void ToSeqAlign(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                    TObjList& objs) const;
};
//
// single conversion interface
//
class NCBI_GUICORE_EXPORT CObjectConverter
{
public:
    typedef IObjConverter::TObjList TObjList;
    //
    // single callable interface
    //
    static void Convert(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                        const CTypeInfo* info, TObjList& objs);
    static void Convert(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                        const string& type_name, TObjList& objs);
    // register a conversion function object
    static void Register(const CTypeInfo* from_type, IObjConverter& cvt);
};
//
// CConvertCache holds a cache of converted objects
// This is useful in situation in which a given object may be requested
// as a given type multiple times in a row.
//
class NCBI_GUICORE_EXPORT CConvertCache : public CObject
{
public:
     // re-typedef from CObjectConvert
     typedef CObjectConverter::TObjList TObjList;
     // convert an object using a CTypeInfo object
     virtual const TObjList& Convert(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                                     const CTypeInfo* info);
     // convert an object using a string-based type name
     virtual const TObjList& Convert(objects::CScope& scope, const CObject& obj,
                                     const string& type_name);
    // SCacheKey holds the information relevant for a single converted
    // object
    struct SCacheKey
    {
        SCacheKey(objects::CScope& scope, const CObject& obj, 
                  const string& type)
        : m_Scope(&scope),
          m_Obj(&obj),
          m_Type(type)
        {}
        SCacheKey (const SCacheKey& key)
        : m_Scope(key.m_Scope),
          m_Obj(key.m_Obj),
          m_Type(key.m_Type)
        {}
        CConstRef<objects::CScope>  m_Scope;
        CConstRef<CObject> m_Obj;
        string             m_Type;
    };
    // functor for sorting SCacheKey objects
    struct SCacheKeySort
    {
        bool operator() (const SCacheKey& key1, const SCacheKey& key2) const;
    };
private:
    // the cache itself
    typedef map<SCacheKey, TObjList, SCacheKeySort> TCache;
    TCache m_ObjCache;
    // empty list of objects to be returned if no hits found
    TObjList m_EmptyObjList;
};
END_NCBI_SCOPE
/*
 * ===========================================================================
 * $Log: obj_convert.hpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/04/12 18:12:36  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.9
 *
 * Revision 1.9  2004/01/21 12:38:17  dicuccio
 * redesigned CObjectCOnverter API to eliminate temporary object creation
 *
 * Revision 1.8  2004/01/20 18:09:07  dicuccio
 * Export CObjectConverter
 *
 * Revision 1.7  2004/01/15 18:02:34  dicuccio
 * API change for IObjConverter - pass-by-reference instead of return-by-value
 *
 * Revision 1.6  2003/10/10 18:07:07  friedman
 * SCacheKey and SCacheKeySort needs to be public for solaris compile
 *
 * Revision 1.5  2003/10/10 17:11:48  dicuccio
 * Code clean-up.  Added export specifiers, removed #ifdef'd code.  Privatized all
 * internals of CConvertCache
 *
 * Revision 1.4  2003/10/10 16:00:45  friedman
 * Added CConvertCache
 *
 * Revision 1.3  2003/09/30 15:19:22  dicuccio
 * Added default conversions for seq-entry, bioseq
 *
 * Revision 1.2  2003/09/25 12:26:34  friedman
 * Added:
 *         ToSeqAlign
 *
 * Revision 1.1  2003/09/16 14:03:05  dicuccio
 * Initial revision
 *
 * ===========================================================================
 */
#endif  // GUI_CORE___OBJ_CONVERT__HPP

						