cdd.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: cdd.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2003/12/02 20:32:08  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef OBJTOOLS_DATA_LOADERS_CDD___CDD__HPP
  10. #define OBJTOOLS_DATA_LOADERS_CDD___CDD__HPP
  11. /*  $Id: cdd.hpp,v 1000.1 2003/12/02 20:32:08 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Author: Philip Johnson, Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description: CDD consensus sequence data loader
  39.  *
  40.  * ===========================================================================
  41.  */
  42. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  43. #include <corelib/ncbimtx.hpp>
  44. #include <objmgr/data_loader.hpp>
  45. #include <map>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. BEGIN_SCOPE(objects)
  48. //
  49. // class CCddDataLoader is used to retrieve consensus sequences from
  50. // the CDD server
  51. //
  52. class NCBI_XLOADER_CDD_EXPORT CCddDataLoader : public CDataLoader
  53. {
  54. public:
  55.     CCddDataLoader(void);
  56.     void GetRecords(const CSeq_id_Handle& idh, EChoice choice);
  57. private:
  58.     // cached map of resolved consensus sequences
  59.     typedef map<int, CRef<CSeq_entry> > TCddEntries;
  60.     TCddEntries m_Entries;
  61.     // mutex guarding input into the map
  62.     CMutex m_Mutex;
  63. };
  64. END_SCOPE(objects)
  65. END_NCBI_SCOPE
  66. /*
  67.  * ===========================================================================
  68.  * $Log: cdd.hpp,v $
  69.  * Revision 1000.1  2003/12/02 20:32:08  gouriano
  70.  * PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.2
  71.  *
  72.  * Revision 1.2  2003/11/28 13:14:38  dicuccio
  73.  * Dropped const from EChoice to match base class API
  74.  *
  75.  * Revision 1.1  2003/10/20 17:48:05  dicuccio
  76.  * Initial revision
  77.  *
  78.  * ===========================================================================
  79.  */
  80. #endif  // OBJTOOLS_DATA_LOADERS_CDD___CDD__HPP