sqlite_table.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: sqlite_table.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 20:58:09  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.1
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef OBJTOOLS_DATA_LOADERS___SQLITE_TABLE__HPP
  10. #define OBJTOOLS_DATA_LOADERS___SQLITE_TABLE__HPP
  11. /*  $Id: sqlite_table.hpp,v 1000.0 2003/10/29 20:58:09 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <objtools/data_loaders/table/table.hpp>
  42. BEGIN_NCBI_SCOPE
  43. class CSQLite;
  44. //
  45. // class CSQLiteTable implements the core functionality for reading a
  46. // demilited file as a SQLite database
  47. //
  48. class NCBI_XLOADER_TABLE_EXPORT CSQLiteTable : public ITableData
  49. {
  50. public:
  51.     CSQLiteTable(const string& input_file,
  52.                      const string& temp_file,
  53.                      bool delete_file = true);
  54.     virtual ~CSQLiteTable();
  55.     // retrieve the number of rows in the table
  56.     int GetNumRows(void) const;
  57.     // retrieve the number of columns in the table
  58.     int GetNumCols(void) const;
  59.     // retrieve a single, numbered row
  60.     virtual void GetRow        (int row, list<string>& data) const;
  61.     // retrieve the title for a given column
  62.     virtual void GetColumnTitle(int col, string& title) const;
  63.     // retrieve a list of the columns in the table
  64.     virtual void GetColumnTitles(list<string>& titles) const;
  65.     // access an iterator for the entire table
  66.     virtual TIterator Begin(void);
  67.     // obtain an iterator valid for a given ID
  68.     virtual TIterator Begin(const objects::CSeq_id& id);
  69.     // obtain an iterator valid for a given location
  70.     virtual TIterator Begin(const objects::CSeq_loc& id);
  71.     // obtain an iterator valid for a given SQL query
  72.     virtual TIterator Begin(const string& query);
  73.     // retrieve the SQLite object behind the database
  74.     CSQLite& SetDB(void);
  75. protected:
  76.     // the SQLite db we manage
  77.     CRef<CSQLite> m_Sqlite;
  78.     // the list of columns in the SQLite DB.
  79.     vector<string> m_Cols;
  80.     // counter for the number of rows in the database
  81.     int m_NumRows;
  82.     // flag: should the SQLite DB be deleted on exit?
  83.     bool m_DeleteFile;
  84.     // the name of the file we parsed
  85.     string m_FileName;
  86.     // the name of the temporary file we've created
  87.     string m_TmpFileName;
  88. private:
  89.     void x_CleanUp();
  90.     // prohibit copying!
  91.     CSQLiteTable(const CSQLiteTable&);
  92.     CSQLiteTable& operator=(const CSQLiteTable&);
  93. };
  94. END_NCBI_SCOPE
  95. /*
  96.  * ===========================================================================
  97.  * $Log: sqlite_table.hpp,v $
  98.  * Revision 1000.0  2003/10/29 20:58:09  gouriano
  99.  * PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.1
  100.  *
  101.  * Revision 1.1  2003/10/02 17:50:00  dicuccio
  102.  * Moved table reader into the data loader project, as it depends on SQLite
  103.  *
  104.  * Revision 1.1  2003/10/02 17:33:33  dicuccio
  105.  * Initial revision
  106.  *
  107.  * ===========================================================================
  108.  */
  109. #endif  // OBJTOOLS_DATA_LOADERS___SQLITE_TABLE__HPP