生物技术

开发平台：
C/C++

seqdbcommon.hpp：源码内容
							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: seqdbcommon.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/04/15 15:04:51  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.7
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
#ifndef CORELIB__SEQDB__SEQDBCOMMON_HPP
#define CORELIB__SEQDB__SEQDBCOMMON_HPP
/*  $Id: seqdbcommon.hpp,v 1000.0 2004/04/15 15:04:51 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
 *  Please cite the author in any work or product based on this material.
 *
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 *
 * Author:  Kevin Bealer
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 */
#include <ncbiconf.h>
#include <corelib/ncbiobj.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
// Publically visible seqdb related definitions.
class CSeqDBException : public CException {
public:
    enum EErrCode {
        eArgErr,
        eFileErr,
        eMemErr
    };
    
    virtual const char* GetErrCodeString(void) const {
        switch ( GetErrCode() ) {
        case eArgErr:         return "eArgErr";
        case eFileErr:        return "eFileErr";
        case eMemErr:         return "eMemErr";
        default:              return CException::GetErrCodeString();
        }
    }
    
    NCBI_EXCEPTION_DEFAULT(CSeqDBException,CException);
};
// Protein / Nucleotide / Unknown are represented by 'p', 'n', and '-'.
const char kSeqTypeProt = 'p';
const char kSeqTypeNucl = 'n';
const char kSeqTypeUnkn = '-';
// Two output formats, used by CSeqDB::GetAmbigSeq(...)
const Uint4 kSeqDBNuclNcbiNA8  = 0;
const Uint4 kSeqDBNuclBlastNA8 = 1;
// Flag specifying whether to use memory mapping.
const bool kSeqDBMMap   = true;
const bool kSeqDBNoMMap = false;
// Certain methods have an "Alloc" version; if this is used, the
// following can be used to indicate how to allocate returned data, so
// that the user can use corresponding methods to delete the data.
enum ESeqDBAllocType {
    eMalloc = 1,
    eNew
};
END_NCBI_SCOPE
#endif // CORELIB__SEQDB__SEQDBCOMMON_HPP

						