flat_table_formatter.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: flat_table_formatter.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 21:00:20  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef OBJECTS_FLAT___FLAT_TABLE_FORMATTER__HPP
  10. #define OBJECTS_FLAT___FLAT_TABLE_FORMATTER__HPP
  11. /*  $Id: flat_table_formatter.hpp,v 1000.0 2003/10/29 21:00:20 gouriano Exp $
  12. * ===========================================================================
  13. *
  14. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15. *               National Center for Biotechnology Information
  16. *
  17. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23. *
  24. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30. *  purpose.
  31. *
  32. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33. *
  34. * ===========================================================================
  35. *
  36. * Author:  Aaron Ucko, NCBI
  37. *
  38. * File Description:
  39. *   new (early 2003) flat-file generator -- 5-column tabular output
  40. *
  41. */
  42. #include <objtools/flat/flat_text_formatter.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. BEGIN_SCOPE(objects)
  45. class NCBI_FLAT_EXPORT CFlatTableFormatter : public IFlatFormatter
  46. {
  47. public:
  48.     CFlatTableFormatter(IFlatTextOStream& stream, CScope& scope,
  49.                         EStyle style = eStyle_Normal, TFlags flags = 0)
  50.         : IFlatFormatter(scope, eMode_Dump, style, flags), m_Stream(&stream)
  51.         { }
  52. protected: // mostly no-ops
  53.     EDatabase GetDatabase(void) const { return eDB_NCBI; }
  54.     void BeginSequence   (CFlatContext& ctx);
  55.     void FormatHead      (const CFlatHead& head);
  56.     void FormatKeywords  (const CFlatKeywords& keys)   { }
  57.     void FormatSegment   (const CFlatSegment& seg)     { }
  58.     void FormatSource    (const CFlatSource& source)   { }
  59.     void FormatReference (const CFlatReference& ref)   { }
  60.     void FormatComment   (const CFlatComment& comment) { }
  61.     void FormatPrimary   (const CFlatPrimary& prim)    { }
  62.     void FormatFeatHeader(const CFlatFeatHeader& fh)   { }
  63.     void FormatFeature   (const IFlattishFeature& f);
  64.     void FormatDataHeader(const CFlatDataHeader& dh)   { }
  65.     void FormatData      (const CFlatData& data)       { }
  66.     void FormatContig    (const CFlatContig& contig)   { }
  67.     void FormatWGSRange  (const CFlatWGSRange& range)  { }
  68.     void FormatGenomeInfo(const CFlatGenomeInfo& g)    { }
  69.     void EndSequence     (void)                        { }
  70. private:
  71.     CRef<IFlatTextOStream> m_Stream;
  72. };
  73. END_SCOPE(objects)
  74. END_NCBI_SCOPE
  75. /*
  76. * ===========================================================================
  77. *
  78. * $Log: flat_table_formatter.hpp,v $
  79. * Revision 1000.0  2003/10/29 21:00:20  gouriano
  80. * PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.5
  81. *
  82. * Revision 1.5  2003/10/09 17:01:49  dicuccio
  83. * Added export specifiers
  84. *
  85. * Revision 1.4  2003/10/09 15:53:58  ucko
  86. * Remember to define GetDatabase (-> NCBI)
  87. *
  88. * Revision 1.3  2003/06/02 16:01:39  dicuccio
  89. * Rearranged include/objects/ subtree.  This includes the following shifts:
  90. *     - include/objects/alnmgr --> include/objtools/alnmgr
  91. *     - include/objects/cddalignview --> include/objtools/cddalignview
  92. *     - include/objects/flat --> include/objtools/flat
  93. *     - include/objects/objmgr/ --> include/objmgr/
  94. *     - include/objects/util/ --> include/objmgr/util/
  95. *     - include/objects/validator --> include/objtools/validator
  96. *
  97. * Revision 1.2  2003/04/10 20:08:22  ucko
  98. * Arrange to pass the item as an argument to IFlatTextOStream::AddParagraph
  99. *
  100. * Revision 1.1  2003/03/28 19:04:23  ucko
  101. * Add a formatter for 5-column tabular output.
  102. *
  103. *
  104. * ===========================================================================
  105. */
  106. #endif  /* OBJECTS_FLAT___FLAT_TABLE_FORMATTER__HPP */