lds_reader.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: lds_reader.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 21:00:57  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef LDS_READER_HPP__
  10. #define LDS_READER_HPP__
  11. /*  $Id: lds_reader.hpp,v 1000.0 2003/10/29 21:00:57 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Author: Anatoliy Kuznetsov
  37.  *
  38.  * File Description:  LDS reader.
  39.  *
  40.  */
  41. #include <objects/seqset/Seq_entry.hpp>
  42. #include <objects/seq/Seq_annot.hpp>
  43. #include <objtools/lds/lds.hpp>
  44. #include <map>
  45. BEGIN_NCBI_SCOPE
  46. BEGIN_SCOPE(objects)
  47. // Load top level seq entry.
  48. CRef<CSeq_entry> NCBI_LDS_EXPORT LDS_LoadTSE(SLDS_TablesCollection& lds_db, 
  49.                                              const map<string, int>& type_map,
  50.                                              int object_id);
  51. // Load annotation.
  52. CRef<CSeq_annot> 
  53. NCBI_LDS_EXPORT LDS_LoadAnnot(SLDS_TablesCollection& lds_db, 
  54.                               const CLDS_Query::SObjectDescr& obj_descr);
  55. END_SCOPE(objects)
  56. END_NCBI_SCOPE
  57. /*
  58.  * ===========================================================================
  59.  * $Log: lds_reader.hpp,v $
  60.  * Revision 1000.0  2003/10/29 21:00:57  gouriano
  61.  * PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.4
  62.  *
  63.  * Revision 1.4  2003/07/14 19:46:26  kuznets
  64.  * + annotation reading function
  65.  *
  66.  * Revision 1.3  2003/06/11 15:35:44  kuznets
  67.  * + DLL export/import specifier
  68.  *
  69.  * Revision 1.2  2003/06/09 18:05:12  kuznets
  70.  * Changed prototype of the CSeq_entry reading function (LDS_LoadTSE)
  71.  *
  72.  * Revision 1.1  2003/06/06 20:01:45  kuznets
  73.  * Initial revision.
  74.  *
  75.  * ===========================================================================
  76.  */
  77. #endif