ftable_formatter.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: ftable_formatter.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:38:39  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef OBJTOOLS_FORMAT___FTABLE_FORMATTER__HPP
  10. #define OBJTOOLS_FORMAT___FTABLE_FORMATTER__HPP
  11. /*  $Id: ftable_formatter.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:38:39 gouriano Exp $
  12. * ===========================================================================
  13. *
  14. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15. *               National Center for Biotechnology Information
  16. *
  17. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23. *
  24. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30. *  purpose.
  31. *
  32. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33. *
  34. * ===========================================================================
  35. *
  36. * Author:  Aaron Ucko, NCBI
  37. *          Mati Shomrat
  38. *
  39. * File Description:
  40. *   5-Column feature table formatting
  41. */
  42. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  43. #include <objtools/format/item_formatter.hpp>
  44. #include <objtools/format/items/feature_item.hpp>
  45. BEGIN_NCBI_SCOPE
  46. BEGIN_SCOPE(objects)
  47. class CSeq_loc;
  48. class CFtableFormatter : public CFlatItemFormatter
  49. {
  50. public:
  51.     CFtableFormatter(void);
  52.     void FormatReference(const CReferenceItem& keys, IFlatTextOStream& text_os);
  53.     void FormatFeatHeader(const CFeatHeaderItem& fh, IFlatTextOStream& text_os);
  54.     void FormatFeature(const CFeatureItemBase& feat, IFlatTextOStream& text_os);
  55. private:
  56.     void x_FormatLocation(const CSeq_loc& loc, const string& key,
  57.         CBioseqContext& ctx, list<string>& l);
  58.     void x_FormatQuals(const CFlatFeature::TQuals& quals, CBioseqContext& ctx,
  59.         list<string>& l);
  60. };
  61. END_SCOPE(objects)
  62. END_NCBI_SCOPE
  63. /*
  64. * ===========================================================================
  65. *
  66. * $Log: ftable_formatter.hpp,v $
  67. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:38:39  gouriano
  68. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  69. *
  70. * Revision 1.3  2004/04/22 15:43:56  shomrat
  71. * Changes in context
  72. *
  73. * Revision 1.2  2004/04/07 14:51:46  shomrat
  74. * Fixed typo
  75. *
  76. * Revision 1.1  2004/04/07 14:25:28  shomrat
  77. * Initial Revision
  78. *
  79. *
  80. * ===========================================================================
  81. */
  82. #endif  /* OBJTOOLS_FORMAT___FTABLE_FORMATTER__HPP */