genbank_gather.hpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: genbank_gather.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:38:55  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef OBJTOOLS_FORMAT___GENBANK_GATHER__HPP
  10. #define OBJTOOLS_FORMAT___GENBANK_GATHER__HPP
  11. /*  $Id: genbank_gather.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:38:55 gouriano Exp $
  12. * ===========================================================================
  13. *
  14. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15. *               National Center for Biotechnology Information
  16. *
  17. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23. *
  24. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30. *  purpose.
  31. *
  32. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33. *
  34. * ===========================================================================
  35. *
  36. * Author:  Aaron Ucko, NCBI
  37. *          Mati Shomrat
  38. *
  39. * File Description:
  40. *
  41. */
  42. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  43. #include <objtools/format/gather_items.hpp>
  44. BEGIN_NCBI_SCOPE
  45. BEGIN_SCOPE(objects)
  46. class CBioseqContext;
  47. class CBioseq;
  48. class CGenbankGatherer : public CFlatGatherer
  49. {
  50. public:
  51.     CGenbankGatherer(void);
  52.     virtual void x_DoSingleSection(CBioseqContext& ctx) const;
  53. private:
  54.     void x_GatherWGS(CBioseqContext& ctx) const;
  55. };
  56. END_SCOPE(objects)
  57. END_NCBI_SCOPE
  58. /*
  59. * ===========================================================================
  60. *
  61. * $Log: genbank_gather.hpp,v $
  62. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:38:55  gouriano
  63. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  64. *
  65. * Revision 1.4  2004/04/22 15:45:40  shomrat
  66. * Changes in context
  67. *
  68. * Revision 1.3  2004/03/25 20:31:51  shomrat
  69. * Use handles
  70. *
  71. * Revision 1.2  2004/01/14 15:55:08  shomrat
  72. * *** empty log message ***
  73. *
  74. * Revision 1.1  2003/12/17 19:53:18  shomrat
  75. * Initial revision (adapted from flat lib)
  76. *
  77. *
  78. * ===========================================================================
  79. */
  80. #endif  /* OBJTOOLS_FORMAT___GENBANK_GATHER__HPP */