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dbsource_item.hpp
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：3k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

dbsource_item.hpp：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: dbsource_item.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:39:25  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. #ifndef OBJTOOLS_FORMAT_ITEMS___DBSOURCE_ITEM__HPP
  11. #define OBJTOOLS_FORMAT_ITEMS___DBSOURCE_ITEM__HPP
  13. /*  $Id: dbsource_item.hpp,v 1000.1 2004/06/01 19:39:25 gouriano Exp $
  14. * ===========================================================================
  15. *
  16. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  17. *               National Center for Biotechnology Information
  18. *
  19. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  20. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  21. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  22. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  23. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  24. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  25. *
  26. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  27. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  28. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  29. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  30. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  31. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  32. *  purpose.
  33. *
  34. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  35. *
  36. * ===========================================================================
  37. *
  38. * Author: Mati Shomrat
  39. *
  40. * File Description:
  41. *   
  42. */
  43. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  45. #include <objtools/format/items/item_base.hpp>
  48. BEGIN_NCBI_SCOPE
  49. BEGIN_SCOPE(objects)
  51. class CSeq_id;
  52. class CBioseqContext;
  53. class IFormatter;
  56. ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  57. //
  58. // DBSOURCE
  60. class CDBSourceItem : public CFlatItem
  61. {
  62. public:
  63.     typedef list<string> TDBSource;
  65.     CDBSourceItem(CBioseqContext& ctx);
  66.     void Format(IFormatter& formatter, IFlatTextOStream& text_os) const;
  67.     
  68.     const TDBSource& GetDBSource(void) const { return m_DBSource; }
  70. private:
  71.     void x_GatherInfo(CBioseqContext& ctx);
  72.     void x_AddPIRBlock(CBioseqContext& ctx);
  73.     void x_AddSPBlock(CBioseqContext& ctx);
  74.     void x_AddPRFBlock(CBioseqContext& ctx);
  75.     void x_AddPDBBlock(CBioseqContext& ctx);
  76.     string x_FormatDBSourceID(const CSeq_id& id);
  78.     // data
  79.     TDBSource m_DBSource;
  80. };
  83. END_SCOPE(objects)
  84. END_NCBI_SCOPE
  87. /*
  88. * ===========================================================================
  89. *
  90. * $Log: dbsource_item.hpp,v $
  91. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:39:25  gouriano
  92. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  93. *
  94. * Revision 1.3  2004/04/22 15:35:34  shomrat
  95. * Changes in context
  96. *
  97. * Revision 1.2  2004/03/18 15:26:38  shomrat
  98. * Added missing forward decleration
  99. *
  100. * Revision 1.1  2003/12/17 19:46:04  shomrat
  101. * Initial revision (adapted from flat lib)
  102. *
  103. *
  104. * ===========================================================================
  105. */
  108. #endif  /* OBJTOOLS_FORMAT_ITEMS___DBSOURCE_ITEM__HPP */