Na_strand.hpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: Na_strand.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 17:23:57  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /* $Id: Na_strand.hpp,v 1000.1 2004/04/12 17:23:57 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  Aaron Ucko, NCBI
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *   Simple utilities for deducing directions
  38.  *
  39.  * Remark:
  40.  *   This code was originally generated by application DATATOOL
  41.  *   using specifications from the data definition file
  42.  *   'seqloc.asn'.
  43.  */
  44. #ifndef OBJECTS_SEQLOC_NA_STRAND_HPP
  45. #define OBJECTS_SEQLOC_NA_STRAND_HPP
  46. // generated includes
  47. #include <objects/seqloc/Na_strand_.hpp>
  48. // generated classes
  49. BEGIN_NCBI_SCOPE
  50. BEGIN_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  51. inline
  52. bool IsReverse(ENa_strand s)
  53. {
  54.     // treat unknown as forward
  55.     return (s == eNa_strand_minus  ||  s == eNa_strand_both_rev);
  56. }
  57. inline
  58. bool SameOrientation(ENa_strand a, ENa_strand b)
  59. {
  60.     return IsReverse(a) == IsReverse(b);
  61. }
  62. inline
  63. ENa_strand Reverse(ENa_strand s)
  64. {
  65.     switch ( s ) {
  66.     case eNa_strand_unknown:  // defaults to plus
  67.     case eNa_strand_plus:
  68.         return eNa_strand_minus;
  69.     case eNa_strand_minus:
  70.         return eNa_strand_plus;
  71.     case eNa_strand_both:
  72.         return eNa_strand_both_rev;
  73.     case eNa_strand_both_rev:
  74.         return eNa_strand_both;
  75.     default:
  76.         return s;
  77.     }
  78. }
  79. END_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  80. END_NCBI_SCOPE
  81. /*
  82. * ===========================================================================
  83. *
  84. * $Log: Na_strand.hpp,v $
  85. * Revision 1000.1  2004/04/12 17:23:57  gouriano
  86. * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.4
  87. *
  88. * Revision 1.4  2004/02/19 18:00:50  shomrat
  89. * changed logic to match C toolkit
  90. *
  91. * Revision 1.3  2003/12/18 02:55:52  ucko
  92. * Rework Reverse to avoid warnings about unhandled cases.
  93. *
  94. * Revision 1.2  2003/08/27 14:20:27  vasilche
  95. * Added Reverse(ENa_strand).
  96. *
  97. * Revision 1.1  2002/11/12 19:53:25  ucko
  98. * Add simple utilities to distinguish forward- and reverse-orientation strands.
  99. *
  100. *
  101. * ===========================================================================
  102. */
  103. #endif // OBJECTS_SEQLOC_NA_STRAND_HPP
  104. /* Original file checksum: lines: 63, chars: 1928, CRC32: 1071d9d3 */