Seq_point.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: Seq_point.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 19:30:59  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /* $Id: Seq_point.hpp,v 1000.2 2004/06/01 19:30:59 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  .......
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *   .......
  38.  *
  39.  * Remark:
  40.  *   This code was originally generated by application DATATOOL
  41.  *   using specifications from the ASN data definition file
  42.  *   'seqloc.asn'.
  43.  *
  44.  * ---------------------------------------------------------------------------
  45.  * $Log: Seq_point.hpp,v $
  46.  * Revision 1000.2  2004/06/01 19:30:59  gouriano
  47.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  48.  *
  49.  * Revision 1.7  2004/05/06 16:54:41  shomrat
  50.  * Added methods to set partial left and right
  51.  *
  52.  * Revision 1.6  2004/01/28 19:06:52  shomrat
  53.  * Added methods to ease the construction of objects
  54.  *
  55.  * Revision 1.5  2002/12/26 12:43:42  dicuccio
  56.  * Added Win32 export specifiers
  57.  *
  58.  * Revision 1.4  2002/09/12 21:14:20  kans
  59.  * IsPartialLeft and IsPartialRight are const
  60.  *
  61.  * Revision 1.3  2002/09/12 20:39:03  kans
  62.  * added member functions IsPartialLeft and IsPartialRight
  63.  *
  64.  * Revision 1.2  2002/06/06 20:50:50  clausen
  65.  * Moved IsValid to objects/util/sequence.cpp
  66.  *
  67.  * Revision 1.1  2002/01/10 19:11:02  clausen
  68.  * Commiting add
  69.  *
  70.  *
  71.  * ===========================================================================
  72.  */
  73. #ifndef OBJECTS_SEQLOC_SEQ_POINT_HPP
  74. #define OBJECTS_SEQLOC_SEQ_POINT_HPP
  75. // generated includes
  76. #include <objects/seqloc/Seq_point_.hpp>
  77. // generated classes
  78. BEGIN_NCBI_SCOPE
  79. BEGIN_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  80. class NCBI_SEQLOC_EXPORT CSeq_point : public CSeq_point_Base
  81. {
  82.     typedef CSeq_point_Base Tparent;
  83. public:
  84.     // constructor
  85.     CSeq_point(void);
  86.     CSeq_point(TId& id, TPoint point, TStrand strand = eNa_strand_unknown);
  87.     // destructor
  88.     ~CSeq_point(void);
  89.     // check left (5') or right (3') end of location for e_Lim fuzz
  90.     bool IsPartialLeft  (void) const;
  91.     bool IsPartialRight (void) const;
  92.     // set / remove e_Lim fuzz on left (5') or right (3') end
  93.     void SetPartialLeft (bool val);
  94.     void SetPartialRight(bool val);
  95.         
  96. private:
  97.     // Prohibit copy constructor and assignment operator
  98.     CSeq_point(const CSeq_point& value);
  99.     CSeq_point& operator=(const CSeq_point& value);
  100.     bool x_IsMinusStrand(void) const;
  101. };
  102. /////////////////// CSeq_point inline methods
  103. // constructor
  104. inline
  105. CSeq_point::CSeq_point(void)
  106. {
  107. }
  108. inline
  109. CSeq_point::CSeq_point(TId& id, TPoint point, TStrand strand)
  110. {
  111.     SetPoint(point);
  112.     SetId(id);
  113.     if ( strand != eNa_strand_unknown ) {
  114.         SetStrand(strand);
  115.     }
  116. }
  117. /////////////////// end of CSeq_point inline methods
  118. END_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  119. END_NCBI_SCOPE
  120. #endif // OBJECTS_SEQLOC_SEQ_POINT_HPP
  121. /* Original file checksum: lines: 90, chars: 2400, CRC32: 5b2ee1f6 */