seq_vector_cvt_gcc_i386.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: seq_vector_cvt_gcc_i386.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 20:25:57  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.1
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef SEQ_VECTOR_CVT_GCC_I386__HPP
  10. #define SEQ_VECTOR_CVT_GCC_I386__HPP
  11. /*  $Id: seq_vector_cvt_gcc_i386.hpp,v 1000.0 2003/10/29 20:25:57 gouriano Exp $
  12. * ===========================================================================
  13. *
  14. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15. *               National Center for Biotechnology Information
  16. *
  17. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23. *
  24. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30. *  purpose.
  31. *
  32. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33. *
  34. * ===========================================================================
  35. *
  36. * Author: Eugene Vasilchenko
  37. *
  38. * File Description:
  39. *   Seq-vector conversion functions for Intel CPU with GCC.
  40. *
  41. */
  42. #include <objmgr/impl/seq_vector_cvt_gen.hpp>
  43. #if 0
  44. template<class SrcCont>
  45. void copy_2bit_table(char* dst, size_t count,
  46.                      const SrcCont& srcCont, size_t srcPos,
  47.                      const char* table)
  48. {
  49.     const char* src = &srcCont[srcPos / 4];
  50.     {
  51.         // odd chars first
  52.         char c = *src;
  53.         switch ( srcPos % 4 ) {
  54.         case 1:
  55.             *(dst++) = table[(c >> 4) & 0x03];
  56.             if ( --count == 0 ) return;
  57.             // intentional fall through 
  58.         case 2:
  59.             *(dst++) = table[(c >> 2) & 0x03];
  60.             if ( --count == 0 ) return;
  61.             // intentional fall through 
  62.         case 3:
  63.             *(dst++) = table[(c     ) & 0x03];
  64.             ++src;
  65.             --count;
  66.             break;
  67.         }
  68.     }
  69.     for ( DstIter end = dst + (count & ~3); dst != end; dst += 4, ++src ) {
  70.         char c3 = *src;
  71.         char c0 = c3 >> 6;
  72.         char c1 = c3 >> 4;
  73.         char c2 = c3 >> 2;
  74.         c0 = table[c0 & 0x03];
  75.         c1 = table[c1 & 0x03];
  76.         *(dst  ) = c0;
  77.         c2 = table[c2 & 0x03];
  78.         *(dst+1) = c1;
  79.         c3 = table[c3 & 0x03];
  80.         *(dst+2) = c2;
  81.         *(dst+3) = c3;
  82.     }
  83.     // remaining odd chars
  84.     switch ( count % 4 ) {
  85.     case 3:
  86.         *(dst+2) = table[(*src >> 2) & 0x03];
  87.         // intentional fall through
  88.     case 2:
  89.         *(dst+1) = table[(*src >> 4) & 0x03];
  90.         // intentional fall through
  91.     case 1:
  92.         *(dst  ) = table[(*src >> 6) & 0x03];
  93.         break;
  94.     }
  95.     copy_2bit_table_up(dst, count, src, table
  96.     copy_2bit_table(ds
  97.     asm volatile("lock; xaddl %1, %0" : "=m" (*nv_value_p), "=r" (result)
  98.                  : "1" (delta), "m" (*nv_value_p));
  99. #endif
  100. #endif//SEQ_VECTOR_CVT_GCC_I386__HPP