生物技术

开发平台：
C/C++

prot_prop.hpp：源码内容
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 * PRODUCTION $Log: prot_prop.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 18:04:33  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.6
 * PRODUCTION
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 */
/*  $Id: prot_prop.hpp,v 1000.2 2004/06/01 18:04:33 gouriano Exp $
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 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
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 *
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 *
 * Authors:  Josh Cherry
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 * File Description:
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#ifndef ALGO_SEQUENCE___PROT_PROP__HPP
#define ALGO_SEQUENCE___PROT_PROP__HPP
#include <objmgr/seq_vector.hpp>
#include <math.h>
BEGIN_NCBI_SCOPE
BEGIN_SCOPE(objects)
/// This class defines functions for calculating
/// properties of amino acid sequences.
class NCBI_XALGOSEQ_EXPORT CProtProp
{
public:
    /// Counts the numbers of occurrences of each residue type.
    static TSeqPos AACount(CSeqVector& v, vector<TSeqPos>& aacount);
    /// Estimates the isoelectric point (pI) of a protein.
    static double GetProteinPI(CSeqVector& v);
    /// Estimates the charge on a protein
    /// at a given pH.
    static double GetProteinCharge(const vector<TSeqPos>& aacount,
                                   CSeqVector::TResidue nter,
                                   CSeqVector::TResidue cter,
                                   double pH);
private:
    static double exp10(double x) { return pow(double(10), x); }
};
END_SCOPE(objects)
END_NCBI_SCOPE
#endif  // ALGO_SEQUENCE___PROT_PROP__HPP
/*
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 * $Log: prot_prop.hpp,v $
 * Revision 1000.2  2004/06/01 18:04:33  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.6
 *
 * Revision 1.6  2004/05/14 01:24:15  jcherry
 * Pass vector by reference
 *
 * Revision 1.5  2003/12/11 17:30:44  ivanov
 * Explicit Using pow(double,double) to avoid compilation problems on MSVC7
 *
 * Revision 1.4  2003/08/04 15:43:20  dicuccio
 * Modified export specifiers to be more flexible
 *
 * Revision 1.3  2003/07/01 19:00:44  ucko
 * Drop gratuitous GUI header inclusion; minor formal cleanups
 *
 * Revision 1.2  2003/07/01 17:31:25  dicuccio
 * Added Win32 export specifiers
 *
 * Revision 1.1  2003/07/01 15:11:24  jcherry
 * Initial versions of nuc_prop and prot_prop
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 */

						