blast_dust.h
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:2k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: blast_dust.h,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 18:03:20  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.10
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /* $Id: blast_dust.h,v 1000.2 2004/06/01 18:03:20 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's offical duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  * 
  34.  * Author: Ilya Dondoshansky
  35.  *
  36.  */
  37. /** @file blast_dust.h
  38.  * DUST filtering functions. (shouldn't this be merged with blast_filter?)
  39.  * @todo FIXME: include reference?
  40.  */
  41. #ifndef __BLAST_DUST__
  42. #define __BLAST_DUST__
  43. #ifdef __cplusplus
  44. extern "C" {
  45. #endif
  46. #include <algo/blast/core/blast_def.h>
  47. Int2 SeqBufferDust (Uint1* sequence, Int4 length, Int4 offset,
  48.                     Int2 level, Int2 window, Int2 minwin, Int2 linker,
  49.                     BlastSeqLoc** dust_loc);
  50. #ifdef __cplusplus
  51. }
  52. #endif
  53. #endif /* !__BLAST_FILTER__ */