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ncbi_std.h
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：5k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

ncbi_std.h：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: ncbi_std.h,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.4  2004/06/01 18:04:20  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.28
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. /* $Id: ncbi_std.h,v 1000.4 2004/06/01 18:04:20 gouriano Exp $
  11.  * ===========================================================================
  12.  *
  13.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  14.  *               National Center for Biotechnology Information
  15.  *
  16.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  17.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  18.  *  the author's offical duties as a United States Government employee and
  19.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  20.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  21.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  22.  *
  23.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  24.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  25.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  26.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  27.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  28.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  29.  *  purpose.
  30.  *
  31.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  32.  *
  33.  * ===========================================================================
  34.  *
  35.  * Author: Ilya Dondoshansky
  36.  *
  37.  */
  39. /** @file ncbi_std.h
  40.  * Type and macro definitions from C toolkit that are not defined in C++ 
  41.  * toolkit.
  42.  */
  46. #ifndef __NCBI_STD__
  47. #define __NCBI_STD__
  49. #include <stdio.h>
  50. #include <stdlib.h>
  51. #include <string.h>
  53. #include <math.h>
  54. #include <ctype.h>
  55. #include <assert.h>
  57. /* which toolkit are we using? */
  58. #include "blast_toolkit.h"
  60. #include <algo/blast/core/ncbi_math.h>
  62. #ifdef __cplusplus
  63. extern "C" {
  64. #endif
  66. /* For some reason, ICC claims a suitable __STDC_VERSION__ but then
  67.    barfs on restrict. */
  68. #ifdef __ICC
  69. #define NCBI_RESTRICT __restrict
  70. #elif __STDC_VERSION__ >= 199901
  71. #define NCBI_RESTRICT restrict
  72. #else
  73. #define NCBI_RESTRICT
  74. #endif
  76. /* inlining support -- compiler dependent */
  77. #if defined(__cplusplus)  ||  __STDC_VERSION__ >= 199901
  78. /* C++ and C99 both guarantee "inline" */
  79. #define NCBI_INLINE inline
  80. #elif defined(__GNUC__)
  81. /* So does GCC, normally, but it may be running with strict options
  82.    that require the extra underscores */
  83. #define NCBI_INLINE __inline__
  84. #elif defined(_MSC_VER)  ||  defined(__sgi) || defined(HPUX)
  85. /* MSVC and (older) MIPSpro always require leading underscores */
  86. #define NCBI_INLINE __inline
  87. #else
  88. /* "inline" seems to work on our remaining in-house compilers
  89.    (WorkShop, Compaq, ICC, MPW) */
  90. #define NCBI_INLINE inline
  91. #endif
  93. #ifdef _MSC_VER
  94. #define strcasecmp _stricmp
  95. #define strdup _strdup
  96. #define snprintf _snprintf
  97. #endif
  99. #ifndef _NCBISTD_ /* if we're not in the C toolkit... */
  100. typedef Uint1 Boolean;
  101. #ifndef TRUE
  102. #define TRUE 1
  103. #endif
  104. #ifndef FALSE
  105. #define FALSE 0
  106. #endif
  107. #endif
  109. #ifndef ASSERT
  110. #define ASSERT assert
  111. #endif
  113. #ifndef MIN
  114. #define MIN(a,b) ((a)>(b)?(b):(a))
  115. #endif
  117. #ifndef MAX
  118. #define MAX(a,b) ((a)>=(b)?(a):(b))
  119. #endif
  121. #ifndef ABS
  122. #define ABS(a) ((a)>=0?(a):-(a))
  123. #endif
  125. #ifndef SIGN
  126. #define SIGN(a) ((a)>0?1:((a)<0?-1:0))
  127. #endif
  129. /* low-level ANSI-style functions */
  131. #ifndef _NCBISTD_ /* if we're not in the C toolkit ... */
  132. #define UINT4_MAX     4294967295U
  133. #define INT4_MAX    2147483647
  134. #define INT4_MIN    (-2147483647-1)
  135. #define NCBIMATH_LN2      0.69314718055994530941723212145818
  136. #define LN2         (0.693147180559945)
  137. #define INT2_MAX    32767
  138. #define INT2_MIN    (-32768)
  140. #ifndef DIM
  141. #define DIM(A) (sizeof(A)/sizeof((A)[0]))
  142. #endif
  144. #define NULLB ''
  146. #ifndef PATH_MAX
  147. #define PATH_MAX 1024
  148. #endif
  149. #define DIRDELIMSTR        "/"
  151. #else
  153. #endif /* _NCBISTD_ */
  155. extern void* BlastMemDup (const void *orig, size_t size);
  158. /******************************************************************************/
  160. /** A generic linked list node structure */
  161. typedef struct ListNode {
  162. Uint1 choice;   /* to pick a choice */
  163. void *ptr;              /* attached data */
  164. struct ListNode *next;  /* next in linked list */
  165. } ListNode;
  167. ListNode* ListNodeNew (ListNode* vnp);
  168. ListNode* ListNodeAdd (ListNode** head);
  169. ListNode* ListNodeAddPointer (ListNode** head, Uint1 choice, void *value);
  170. ListNode* ListNodeFree (ListNode* vnp);
  171. ListNode* ListNodeFreeData (ListNode* vnp);
  172. ListNode* ListNodeSort (ListNode* list_to_sort, 
  173.                int (*compar) (const void *, const void *));
  174. ListNode* ListNodeCopyStr (ListNode** head, Uint1 choice, char* str);
  175. Int4 ListNodeLen (ListNode* vnp);
  177. #ifdef __cplusplus
  178. }
  179. #endif
  180. #endif /* !__NCBI_STD__ */