资源说明:库尔卡尼实验室的scRNA-seq巨噬细胞项目
该存储库包含用于分析由Kulkarni实验室生成的scRNA-seq巨噬细胞数据的代码和分析。
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斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie Hicks)( )
庄永宝( )
数据
原始FASTQ文件
FASTQ文件只能从梵天服务器访问(在JHU VPN之后),并且在这里可用:
/mnt/morbo/Data/Sequencing/Raw_Backup/Kulkarni/Kulkarni_10X/fastqs/
将它们复制到JHPCE,并在那里进行分析。
SingleCellExperiment对象
在“预处理”部分的末尾,创建了SingleCellExperiment对象,并在此处提供该对象:
/fastscratch/myscratch/shicks1/scrna-kulkarni-macrophages/data/sce_co
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