资源说明:BayesPairing2 :按序列和比对识别RNA 3D模块
该软件包包括用于以下目的的工具:
识别序列中的RNA 3D模块
创建自己的BayesPairing模型
RNA 3D模块绘图
分别搜索许多序列中的模块(fasta格式)
搜索路线中的模块(斯德哥尔摩格式)
按已知二级结构顺序识别模块。
注意:当前正在构建和测试用户友好的API。 下面描述的样本用法仍在改进中。
BayesPairing2被接受RECOMB 2020
该文章可在biorxiv上找到: ://www.biorxiv.org/content/10.1101/834762v1.abstract
要求
Python 3.6+
Python模块(由我们的安装程序安装)
Networkx 2.1以上
生物蟒
matplotlib
网站徽标
包裹
任何树
pgmpy(包含在内)
RNAlib(安装conda
本源码包内暂不包含可直接显示的源代码文件,请下载源码包。