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nand2vm：nand2vm-nand2tetris Hack平台的纯python实现
... > import nand2vm
# Init from list using big endian
>> > b = nand2vm . BitArray ([ True , True , False , True ])
>> > b
1101
>> > b [ 0 ]
True
>> > b [ 1 ] # Internal using small endian
False
>> > b . data ...
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ComplexCi：带有DataCastle竞争解决方案的复杂网络中的集体影响力（CI）算法的c ++实现
... c ++实现，该算法旨在通过以下方法开发的最佳渗滤来找到复杂网络中最重要的节点（或影响者）：
Morone F，Makse H A.最优渗流在复杂网络中的影响最大化[J]。计算机应用，2006,26（5）：1097-1101 自然，2015，524（7563）：65-U122。
Morone F，Min B，Bo L等。 关键词：大型社交媒体，最优渗透，集体影响力算法科学报告，2016，6。
该项目还涵盖了提出的新算法CI_DR。
朱凤天。 关键词 ...
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硬币：COIN（文本推理）模型
... Wolpert D. 2020年。情境推理是感觉运动功能库学习的基础。 bioRxiv doi：10.1101 / 2020.11.23.394320（）
安装
下载COIN.m文件。
安装以下软件包（以提高代码 ...
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app-qsiprep：扩散MRI的预处理和重建
... 。
参考和参考资源
QSIPrep bioRxiv论文： ：//www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.09.04.24.282269v1
QSIPrep文档： ://qsiprep.readthedocs.io
QSIPrep完整 ...
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GenomeAdmixR
... ）。 您可以观看他的演讲（1分钟后开始音频）
更多信息
可以在随附的论文中找到更多信息，当前可在此处作为预印本： :
版本历史
1.00版-与bioRxiv提交相关的发行版，位于： ：//doi.org/10.1101/2020.10.19.343491 0.66版-改进的重组代码，速度约为以前的两倍0.65版-添加了测试并添加了徽标0.64版-降低了圈复杂度0.63版-更新了随机数生成0.62版-更新为Roxygen 版本0.61-添加了plot_over_time 0
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进化轨迹遗传相互作用
进化轨迹遗传相互作用
出版物
当出于研究目的使用此代码时，请引用：
Chang Chang，Simone Bianco，Ashley Acevedo，Chao Tang，Raul Andino。 遗传相互作用塑造了RNA病毒种群中的进化轨迹。 bioRxiv，2020年， //doi.org/10.1101/2020.01.16.908129
一般说明
可以在上找到有关这项科学研究的非常笼统的描述。
简而言之，该算法的目的是为每种突变体轨迹确定最佳的相互作用模型：无上位性，上位性，克隆干扰，搭便车等 ...
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RNABayesPairing2：BayesPairing的版本2
... 当前正在构建和测试用户友好的API。 下面描述的样本用法仍在改进中。
BayesPairing2被接受RECOMB 2020
该文章可在biorxiv上找到： ://www.biorxiv.org/content/10.1101/834762v1.abstract
要求
Python 3.6+
Python模块（由我们的安装程序安装）
Networkx 2.1以上
生物蟒
matplotlib
网站徽标
包裹
任何树
pgmpy（包含在内）
RNAlib（安装conda
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Celegans-cell2cell：分析秀丽隐杆线虫中的细胞间相互作用
... 引用方式：
Armingol E.，Joshi CJ，Baghdassarian H.，Shamie I.，Ghaddar A.，Chan J.，她的HL，O'Rourke EJ，Lewis NE推断。 bioRxiv ，（2020）。 DOI：10.1101 / 2020.11.22.392292217
安装
本教程适用于Linux和macOS。 所有jupyter笔记本均可在Windows上运行，但步骤4仅适用于基于Unix的操作系统。
安装Anaconda
安装cell2cell
创建一个新 ...
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阈值_QuPath_Extension
... 选择标记将在图像上突出显示对该标记呈阳性的单元格。
您可以保存和应用分类器，还可以将显示的统计信息另存为csv文件。
参考
SPIAT： ：//www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.28.122614v1
潜在错误：
当只考虑较小的ROI时，有时它找不到阈值，并且会引发错误。 如果遇到此错误，请尝试增加ROI。 如果这不起作用，请取消
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